.img/.hdr格式转.nii格式的操作
时间：2022-05-24 09:35:48 | 栏目：Python代码 | 点击：次
MATLAB转格式,需要使用spm package(https://github.com/neurodebian/spm12).
%%img2nii.m-------------------------------------------- %Script to convert hdr/img files to nii. %This script uses SPM function, so you need to install SPM5 or later. %Kiyotaka Nemoto 05-Nov-2014 %select files f = spm_select(Inf,'img$','Select img files to be converted'); %convert img files to nii for i=1:size(f,1) input = deblank(f(i,:)); [pathstr,fname,ext] = fileparts(input); output = strcat(fname,'.nii'); V=spm_vol(input); ima=spm_read_vols(V); V.fname=output; spm_write_vol(V,ima); end
附加一下volume data是如何转surface data的吧…
wb_command -volume-to-surface-mapping ArticParcels_Smithetal.nii /home/murphyhuang/tmp/nii/HCP_fMRI/Q1-Q6_R440.L.flat.32k_fs_LR.surf.gii outL.shape.gii -trilinear
补充知识：数据读取――（.img .hdr）
1、定义
该图像格式含有两部分：一个是图像 ‘.img '，另一个是图像头文件 '.hdr'，该文件记录了图像的信息，如图像尺寸、波段数、数据类型和大小端等。如果缺少头文件，将无法对图像进行读取，因此头文件十分重要。
2、读取
使用Matlab中NifTi包读取。
eg：
img=load_nii(‘D:\a01_101_bmask.hdr')
