Python 存取npy格式数据实例
时间：2020-12-01 11:33:37|栏目：Python代码|点击： 次
数据处理的时候主要通过两个函数
(1):np.save(“test.npy”，数据结构） ----存数据
(2):data =np.load('test.npy") ----取数据
给2个例子如下（存列表）
1、
z = [[[1, 2, 3], ['w']], [[1, 2, 3], ['w']]]
np.save('test.npy', z)
x = np.load('test.npy')
x:
->array([[list([1, 2, 3]), list(['w'])],
[list([1, 2, 3]), list(['w'])]], dtype=object)
2、存字典
x
-> {0: 'wpy', 1: 'scg'}
np.save('test.npy',x)
x = np.load('test.npy')
x
->array({0: 'wpy', 1: 'scg'}, dtype=object)
3、在存为字典格式读取后，需要先调用如下语句
data.item()
将数据numpy.ndarray对象转换为dict
补充知识：python读取mat或npy文件以及将mat文件保存为npy文件（或npy保存为mat）的方法
读取mat文件并存为npy格式文件
具体见代码，注意h5py的转置问题
import numpy as np
from scipy import io
mat = io.loadmat('yourfile.mat')
# 如果报错:Please use HDF reader for matlab v7.3 files
# 改为下一种方式读取
import h5py
mat = h5py.File('yourfile.mat')
# mat文件里可能有多个cell，各对应着一个dataset
# 可以用keys方法查看cell的名字, 现在要用list(mat.keys()),
# 另外，读取要用data = mat.get('名字'), 然后可以再用Numpy转为array
print(mat.keys())
# 可以用values方法查看各个cell的信息
print(mat.values())
# 可以用shape查看维度信息
print(mat['your_dataset_name'].shape)
# 注意，这里看到的shape信息与你在matlab打开的不同
# 这里的矩阵是matlab打开时矩阵的转置
# 所以，我们需要将它转置回来
mat_t = np.transpose(mat['your_dataset_name'])
# mat_t 是numpy.ndarray格式
# 再将其存为npy格式文件
np.save('yourfile.npy', mat_t)
npy文件的读取很简单
import numpy as np
matrix = np.load('yourfile.npy')
可以重新读取npy文件保存为mat文件
方法一（在MATLAB双击打开时遇到了错误：Unable to read MAT-file *********.mat. Not a binary MAT-file. Try load -ASCII to read as text. ）：
import numpy as np
matrix = np.load('yourfile.npy')
f = h5py.File('yourfile.mat', 'w')
f.create_dataset('dataname', data=matrix)
# 这里不会将数据转置
方法二（使用scipy）：
from scipy import io
mat = np.load('rlt_gene_features.npy-layer-3-train.npy')
io.savemat('gene_features.mat', {'gene_features': mat})
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